sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-EJ-A46G	1	61735	2235710	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	2242199	4885168	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	4885421	29909069	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	29909160	32068504	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	32070198	41660008	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	41665952	42065982	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	42070323	45605764	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	45607168	46160246	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	46161254	57507650	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	57513994	60147410	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	60147671	77289927	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	77290001	80793188	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	80793258	81932671	4	1
TCGA-EJ-A46G	1	81933089	84084274	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	84085091	84550876	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	84551489	87612820	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	87616530	99633976	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	99635101	99890722	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	99891896	100645726	5	1
TCGA-EJ-A46G	1	100646077	103613109	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	103613180	110431626	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	110431756	111721060	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	111721240	121741181	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	143285278	146044882	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	146052878	148347307	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	148351372	151487113	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	151498967	152418145	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	152418806	153253445	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	153253557	155697430	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	155704579	159667333	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	159669141	160251913	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	160251934	178600735	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	178601353	179450131	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	179453483	180183125	2	2
TCGA-EJ-A46G	1	180187532	185551531	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	185553555	204434183	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	204434531	205691111	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	205692239	207115047	3	1
TCGA-EJ-A46G	1	207121953	213413331	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	213414514	215980353	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	215980728	232149492	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	232154018	232574518	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	232576883	236459051	1	1
TCGA-EJ-A46G	1	236461990	236765383	2	1
TCGA-EJ-A46G	1	236765523	248930189	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	12784	6475398	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	6476007	6991130	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	6992784	10101217	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	10101788	11657823	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	11659972	18467421	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	18467572	18822252	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	18824278	23679852	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	23681645	24168864	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	24169025	33944284	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	33944549	35796188	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	35796416	42429316	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	42429779	43963300	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	43963826	64053650	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	64054203	64651853	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	64652485	76785119	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	76787859	77225740	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	77226218	131107491	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	131108477	134038731	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	134049072	150457895	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	150458407	151672741	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	151673522	153548567	4	1
TCGA-EJ-A46G	2	153548884	171829780	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	171829794	173443917	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	173448672	174736163	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	174737238	176792509	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	176792579	216708546	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	216708969	218620181	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	218628001	225976172	1	1
TCGA-EJ-A46G	2	225978014	227111615	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	227112919	228401658	3	1
TCGA-EJ-A46G	2	228404140	232477036	2	1
TCGA-EJ-A46G	2	232477908	242147305	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	18667	2342476	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	2342595	4378781	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	4380715	6894470	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	6895145	9379340	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	9379503	29477282	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	29478207	30273016	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	30273179	31220281	4	1
TCGA-EJ-A46G	3	31220814	32378874	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	32384719	59747536	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	59748768	60061374	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	60061388	70257043	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	70257266	72922141	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	72922290	75302630	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	75302835	75794356	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	75800481	104826947	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	104829993	105290258	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	105296096	105871780	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	105878575	108600728	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	108601590	110384984	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	110385419	112430300	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	112431691	114695413	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	114701101	117180939	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	117181002	146935576	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	146935827	151149276	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	151150968	163470070	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	163473332	164694913	4	1
TCGA-EJ-A46G	3	164709494	166499751	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	166502955	169915971	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	169917128	170148845	3	1
TCGA-EJ-A46G	3	170150762	171290213	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	171298039	172204265	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	172204337	172744644	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	172746210	186188570	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	186189649	186490861	3	1
TCGA-EJ-A46G	3	186491736	187728173	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	187728260	187796943	1	0
TCGA-EJ-A46G	3	187797543	193510290	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	193513771	193657175	5	1
TCGA-EJ-A46G	3	193658438	193876100	2	1
TCGA-EJ-A46G	3	193878273	196949888	1	1
TCGA-EJ-A46G	3	196950538	198169247	1	0
TCGA-EJ-A46G	4	12281	20598325	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	20599718	22691241	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	22691543	30661618	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	30662269	32640670	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	32641537	37407480	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	37407515	37864340	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	37865044	48299220	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	48299674	49049185	3	1
TCGA-EJ-A46G	4	49049469	71491085	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	71491381	71869567	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	71872715	79311761	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	79313679	79966031	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	79975155	84145488	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	84147500	84786131	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	84786963	94225130	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	94225904	101026142	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	101026691	117728940	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	117729190	117868560	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	117868703	119469039	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	119469085	120356466	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	120356852	125813214	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	125816656	128410687	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	128410928	137188122	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	137188635	140154741	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	140157150	152861975	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	152864532	153546529	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	153549339	170789831	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	170793471	174330770	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	174332661	179712242	1	1
TCGA-EJ-A46G	4	179712530	180640982	3	1
TCGA-EJ-A46G	4	180641476	182231650	2	1
TCGA-EJ-A46G	4	182235423	190106768	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	15532	42928618	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	42929008	43910646	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	43916505	85962228	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	85962474	86646927	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	86648119	121346678	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	121347646	122723330	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	122727485	125052212	2	2
TCGA-EJ-A46G	5	125053678	125875076	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	125876490	139196986	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	139202790	143045369	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	143047171	154205554	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	154206308	155047576	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	155051817	156560513	1	1
TCGA-EJ-A46G	5	156560888	157218727	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	157219302	157954350	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	157958125	160607477	2	2
TCGA-EJ-A46G	5	160607700	161526895	3	2
TCGA-EJ-A46G	5	161528343	161894251	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	161894462	166508191	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	166508689	168160695	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	168161717	173880940	3	1
TCGA-EJ-A46G	5	173883604	180187132	2	1
TCGA-EJ-A46G	5	180187846	180532420	4	1
TCGA-EJ-A46G	5	180544139	181363319	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	149661	1386462	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	1397260	1586220	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	1589837	7171872	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	7175834	7866813	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	7867179	28285947	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	28287211	28697332	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	28697585	37535093	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	37540330	38472720	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	38472993	40215929	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	40215958	42419308	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	42419761	56684514	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	56687838	60359038	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	60365881	63481873	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	63483202	65458516	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	65461232	67085931	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	67086052	69649846	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	69649864	95446432	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	95446523	96614008	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	96614064	96880305	4	1
TCGA-EJ-A46G	6	96881751	97504645	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	97505869	103561201	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	103561545	105085511	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	105088616	106468816	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	106471323	107075454	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	107075849	114893307	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	114893371	117224204	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	117225442	121613374	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	121613539	125827922	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	125830991	128905471	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	128915522	130999516	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	130999868	149646445	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	149647000	155428360	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	155429085	155728660	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	155732996	159237854	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	159241032	165175137	1	1
TCGA-EJ-A46G	6	165175140	166739038	2	1
TCGA-EJ-A46G	6	166739479	167401277	3	1
TCGA-EJ-A46G	6	167401514	170741917	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	43259	4016801	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	4020226	4336069	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	4336641	11810684	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	11813196	13423489	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	13427367	18626594	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	18627278	24655139	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	24656489	29912865	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	29913927	31632017	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	31632522	52999797	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	53000167	53520293	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	53523054	73347077	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	73347421	74870728	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	74886163	86805303	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	86808948	87278972	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	87284848	96552079	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	96558429	101364439	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	101364496	106424728	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	106427616	109044272	4	1
TCGA-EJ-A46G	7	109046819	120363002	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	120366015	122001612	3	1
TCGA-EJ-A46G	7	122002306	122444781	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	122445147	127985583	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	127985664	130260804	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	130261055	136431575	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	136435371	136955194	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	136957176	153449557	1	1
TCGA-EJ-A46G	7	153449694	153766274	2	1
TCGA-EJ-A46G	7	153766353	159334314	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	81254	8235660	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	8237241	8609589	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	8611301	17898159	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	17898304	20718833	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	20721071	52412635	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	52414821	52897013	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	52897198	64304035	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	64304297	67649204	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	67649503	69320383	1	1
TCGA-EJ-A46G	8	69326878	71724167	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	71724371	75257426	3	1
TCGA-EJ-A46G	8	75257534	89057204	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	89057295	91301412	5	1
TCGA-EJ-A46G	8	91304361	97979053	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	97979180	98369391	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	98370549	119504938	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	119505491	120194201	3	1
TCGA-EJ-A46G	8	120199073	125067727	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	125068026	126870855	5	2
TCGA-EJ-A46G	8	126870869	127643719	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	127644406	133306597	2	1
TCGA-EJ-A46G	8	133308542	133569037	4	1
TCGA-EJ-A46G	8	133573729	145072769	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	46587	27988083	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	27992822	31109269	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	31111745	78577903	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	78581785	82666083	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	82666493	85439672	1	1
TCGA-EJ-A46G	9	85439721	92464269	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	92464420	92548404	5	0
TCGA-EJ-A46G	9	92560356	92560853	4	3
TCGA-EJ-A46G	9	92561015	93494205	2	2
TCGA-EJ-A46G	9	93494301	95146695	3	3
TCGA-EJ-A46G	9	95146748	95871662	3	1
TCGA-EJ-A46G	9	95875148	105586608	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	105586756	107940273	3	1
TCGA-EJ-A46G	9	107940462	110547257	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	110549678	110869338	4	1
TCGA-EJ-A46G	9	110869486	136930596	2	1
TCGA-EJ-A46G	9	136931466	137813437	6	1
TCGA-EJ-A46G	9	137814316	138200944	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	26823	24548978	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	24549342	27570422	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	27570489	37889518	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	37894162	38140662	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	38141368	67058574	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	67060001	71038906	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	71041324	86283923	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	86290021	86801567	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	86812021	99766804	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	99769899	106714857	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	106715107	112631461	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	112631629	113598066	3	1
TCGA-EJ-A46G	10	113604007	114245150	4	1
TCGA-EJ-A46G	10	114245209	114835336	3	1
TCGA-EJ-A46G	10	114836341	123906930	1	1
TCGA-EJ-A46G	10	123913758	125982634	2	1
TCGA-EJ-A46G	10	125983296	133769379	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	198572	2595605	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	2596552	25531653	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	25533237	26742155	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	26745003	27557624	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	27559698	29187132	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	29187338	32628244	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	32629698	35136854	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	35137515	65338922	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	65339117	65339198	3	0
TCGA-EJ-A46G	11	65339698	65372738	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	65373379	66779894	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	66781465	67221477	6	2
TCGA-EJ-A46G	11	67223010	69023926	3	2
TCGA-EJ-A46G	11	69025499	70390687	3	1
TCGA-EJ-A46G	11	70394310	73424969	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	73437538	76533449	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	76535909	77461824	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	77464128	78587519	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	78588744	82288437	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	82288942	83703338	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	83703947	87094843	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	87096898	87416593	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	87419274	92810245	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	92815745	95290282	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	95292733	101156613	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	101156971	102272672	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	102272914	123175997	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	123176195	124575959	4	1
TCGA-EJ-A46G	11	124579772	124986085	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	124987932	131393459	1	1
TCGA-EJ-A46G	11	131397843	131865332	2	1
TCGA-EJ-A46G	11	131865392	135074876	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	51460	4963280	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	4964209	5489814	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	5490480	17832067	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	17833218	19160520	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	19160855	30960676	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	30962191	31928477	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	31928635	50849628	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	50849797	51870482	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	51870741	52339161	3	1
TCGA-EJ-A46G	12	52339384	53935136	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	53938119	55009410	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	55012045	57616380	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	57625196	58965691	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	58967539	63173420	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	63173541	91128809	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	91137089	94339769	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	94340244	105136749	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	105138386	105481136	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	105482556	117868646	1	1
TCGA-EJ-A46G	12	117870277	121066862	2	1
TCGA-EJ-A46G	12	121067502	133201603	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	18452809	20312884	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	20313721	20896386	3	1
TCGA-EJ-A46G	13	20902107	72254397	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	72254739	72585295	2	1
TCGA-EJ-A46G	13	72587297	107861905	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	107862147	110793997	2	1
TCGA-EJ-A46G	13	110794232	113887168	1	1
TCGA-EJ-A46G	13	113888078	114342922	1	0
TCGA-EJ-A46G	14	18225647	21857294	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	21858683	22535852	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	22536839	34156609	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	34159072	34842066	4	1
TCGA-EJ-A46G	14	34843708	36420484	4	3
TCGA-EJ-A46G	14	36421202	38197685	3	2
TCGA-EJ-A46G	14	38200818	47197515	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	47201856	50110359	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	50111950	59777729	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	59777988	60071311	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	60075689	60287410	3	2
TCGA-EJ-A46G	14	60287737	62471870	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	62474448	73242476	1	1
TCGA-EJ-A46G	14	73243605	74013064	2	1
TCGA-EJ-A46G	14	74016850	98406667	1	0
TCGA-EJ-A46G	14	98406701	100547818	2	0
TCGA-EJ-A46G	14	100558097	106877229	1	0
TCGA-EJ-A46G	15	19811075	43932470	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	43933758	46674666	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	46675079	50004111	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	50005689	50569362	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	50576582	56675923	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	56676157	59538571	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	59542641	62284852	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	62286853	62612958	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	62616596	67425879	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	67426444	67740227	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	67740435	75166533	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	75166881	78248333	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	78248489	88891898	1	1
TCGA-EJ-A46G	15	88892107	89828316	2	1
TCGA-EJ-A46G	15	89833568	101928837	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	10777	852351	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	860689	3161319	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	3164685	4646653	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	4654432	5744172	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	5744213	27513641	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	27516491	36048855	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	46429870	53441596	1	1
TCGA-EJ-A46G	16	53441611	53882596	2	1
TCGA-EJ-A46G	16	53882967	90221127	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	150733	1302748	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	1306453	5445873	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	5446652	19226918	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	19245973	21146845	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	21150840	51702890	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	51704000	53807637	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	53808583	59001706	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	59002381	59909569	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	59913308	63514194	3	2
TCGA-EJ-A46G	17	63514291	72308348	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	72309146	72497212	2	1
TCGA-EJ-A46G	17	72502926	74551295	1	1
TCGA-EJ-A46G	17	74551898	83090856	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	48133	2377306	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	2378356	2926799	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	2930140	12976561	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	12976656	14236859	4	1
TCGA-EJ-A46G	18	14239702	31630650	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	31632764	32048657	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	32049993	57984541	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	57988119	58874711	6	3
TCGA-EJ-A46G	18	58876725	60645707	4	2
TCGA-EJ-A46G	18	60645984	61376465	3	1
TCGA-EJ-A46G	18	61380081	77148785	1	1
TCGA-EJ-A46G	18	77149790	78343285	2	1
TCGA-EJ-A46G	18	78346514	80257174	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	90910	12267610	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	12273703	15072820	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	15073035	17459393	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	17460329	18384899	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	18388992	32482713	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	32483326	33653885	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	33660791	34843045	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	34844064	36033959	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	36044818	38844171	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	38844634	50757794	1	1
TCGA-EJ-A46G	19	50761636	51746647	2	2
TCGA-EJ-A46G	19	51747027	52128369	4	1
TCGA-EJ-A46G	19	52132078	54178794	2	1
TCGA-EJ-A46G	19	54179150	55504430	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	55505235	56516237	3	2
TCGA-EJ-A46G	19	56516710	57201137	3	1
TCGA-EJ-A46G	19	57201927	58586487	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	80664	3987329	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	3989526	6278885	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	6279078	6648254	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	6652796	7105081	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	7107089	18184239	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	18185130	18607541	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	18609093	32284722	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	32289495	35471512	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	35471850	43423245	1	1
TCGA-EJ-A46G	20	43426595	46556346	2	1
TCGA-EJ-A46G	20	46556859	64324800	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	10336543	27943609	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	27943668	28554425	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	28560588	34639390	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	34639703	34895121	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	34895793	36274383	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	36278965	39222458	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	39225487	40481754	1	1
TCGA-EJ-A46G	21	40481833	44085401	2	1
TCGA-EJ-A46G	21	44087909	46677045	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	15294545	21575372	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	21579941	22443804	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	22445918	24299996	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	24303296	27647992	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	27648090	33352376	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	33353290	34317385	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	34321933	44422756	1	1
TCGA-EJ-A46G	22	44425214	44655475	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	44656082	45103028	2	2
TCGA-EJ-A46G	22	45106652	45600902	2	1
TCGA-EJ-A46G	22	45601260	50796027	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	251810	2776199	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	2785350	23586783	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	23586908	26502333	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	26505938	35851515	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	35851903	36544648	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	36546423	37695909	3	0
TCGA-EJ-A46G	X	37701137	38927593	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	38929963	96165270	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	96167361	96509496	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	96514306	96910254	5	0
TCGA-EJ-A46G	X	96910313	96935578	4	0
TCGA-EJ-A46G	X	96935650	98725511	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	98730383	100078765	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	100081083	101458043	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	101460417	104794794	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	104799346	105227601	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	105228385	114359391	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	114360067	114677524	2	0
TCGA-EJ-A46G	X	114678531	155699837	1	0
TCGA-EJ-A46G	X	155733777	155754150	1	1
TCGA-EJ-A46G	X	155756190	156004181	2	1
