sample	chr	startpos	endpos	nMajor	nMinor
TCGA-BR-A44U	1	61735	248930189	1	1
TCGA-BR-A44U	2	12784	242147305	1	1
TCGA-BR-A44U	3	18667	5431158	1	1
TCGA-BR-A44U	3	5435675	5804939	1	0
TCGA-BR-A44U	3	5805690	60110703	1	1
TCGA-BR-A44U	3	60112417	60264336	1	0
TCGA-BR-A44U	3	60264652	60472286	0	0
TCGA-BR-A44U	3	60472875	60588813	1	0
TCGA-BR-A44U	3	60588988	60639285	0	0
TCGA-BR-A44U	3	60639368	174840955	1	1
TCGA-BR-A44U	3	174841621	175255053	1	0
TCGA-BR-A44U	3	175255618	198169247	1	1
TCGA-BR-A44U	4	12281	181163736	1	1
TCGA-BR-A44U	4	181168526	181422989	1	0
TCGA-BR-A44U	4	181424749	190106768	1	1
TCGA-BR-A44U	5	15532	59480922	1	1
TCGA-BR-A44U	5	59481421	60151883	1	0
TCGA-BR-A44U	5	60155192	181363319	1	1
TCGA-BR-A44U	6	149661	161920030	1	1
TCGA-BR-A44U	6	161920923	162295304	0	0
TCGA-BR-A44U	6	162300775	162368283	1	0
TCGA-BR-A44U	6	162368881	162392945	3	1
TCGA-BR-A44U	6	162399454	170741917	1	1
TCGA-BR-A44U	7	43259	112584960	4	0
TCGA-BR-A44U	7	112585481	118892107	5	0
TCGA-BR-A44U	7	118901106	119770693	2	0
TCGA-BR-A44U	7	119771310	120145722	7	0
TCGA-BR-A44U	7	120145730	121967950	4	0
TCGA-BR-A44U	7	121968186	159334314	2	0
TCGA-BR-A44U	8	81254	21928666	1	0
TCGA-BR-A44U	8	21933048	23747075	2	1
TCGA-BR-A44U	8	23747217	45935912	1	0
TCGA-BR-A44U	8	45951913	69608497	5	1
TCGA-BR-A44U	8	69609884	88261449	7	1
TCGA-BR-A44U	8	88261635	145072769	6	1
TCGA-BR-A44U	9	46587	27401299	1	0
TCGA-BR-A44U	9	27402111	28676297	1	1
TCGA-BR-A44U	9	28676420	29502778	1	0
TCGA-BR-A44U	9	29503207	32083296	1	1
TCGA-BR-A44U	9	32087211	37403648	2	1
TCGA-BR-A44U	9	37404952	42995504	1	1
TCGA-BR-A44U	9	60840363	105430197	2	1
TCGA-BR-A44U	9	105430366	138200944	3	1
TCGA-BR-A44U	10	26823	76055586	1	1
TCGA-BR-A44U	10	76057821	76182522	1	0
TCGA-BR-A44U	10	76182874	133769379	1	1
TCGA-BR-A44U	11	198572	135074876	1	1
TCGA-BR-A44U	12	51460	133201603	1	1
TCGA-BR-A44U	13	18452809	114342922	2	1
TCGA-BR-A44U	14	18225647	106877229	1	1
TCGA-BR-A44U	15	19811075	101928837	1	1
TCGA-BR-A44U	16	10777	78534373	1	1
TCGA-BR-A44U	16	78534533	78827890	1	0
TCGA-BR-A44U	16	78828450	90221127	1	1
TCGA-BR-A44U	17	150733	22736323	1	0
TCGA-BR-A44U	17	26943385	27340089	21	2
TCGA-BR-A44U	17	27340387	28343420	1	1
TCGA-BR-A44U	17	28346290	29630244	2	1
TCGA-BR-A44U	17	29631205	31445454	1	0
TCGA-BR-A44U	17	31452369	31527787	3	1
TCGA-BR-A44U	17	31528317	31528317	2	0
TCGA-BR-A44U	17	31528914	33864852	2	1
TCGA-BR-A44U	17	33865468	34807582	4	1
TCGA-BR-A44U	17	34811033	37867557	1	0
TCGA-BR-A44U	17	37874488	39194063	4	1
TCGA-BR-A44U	17	39194258	39478637	6	0
TCGA-BR-A44U	17	39484477	40029501	26	0
TCGA-BR-A44U	17	40033417	40442978	5	1
TCGA-BR-A44U	17	40452935	41152680	23	1
TCGA-BR-A44U	17	41152734	41168355	17	6
TCGA-BR-A44U	17	41169778	41921764	4	1
TCGA-BR-A44U	17	41925742	44008812	2	1
TCGA-BR-A44U	17	44009247	48820171	1	0
TCGA-BR-A44U	17	48822342	49901622	1	1
TCGA-BR-A44U	17	49903449	52318482	2	1
TCGA-BR-A44U	17	52330417	80375211	1	0
TCGA-BR-A44U	17	80377185	80567438	10	1
TCGA-BR-A44U	17	80568800	82318990	5	1
TCGA-BR-A44U	17	82326004	83090856	1	0
TCGA-BR-A44U	18	48133	30598044	2	1
TCGA-BR-A44U	18	30603543	80257174	1	0
TCGA-BR-A44U	19	90910	58586487	1	1
TCGA-BR-A44U	20	80664	14618789	2	1
TCGA-BR-A44U	20	14622136	14764552	1	0
TCGA-BR-A44U	20	14765680	15156084	0	0
TCGA-BR-A44U	20	15156471	15487098	1	1
TCGA-BR-A44U	20	15487501	64324800	2	1
TCGA-BR-A44U	21	10336543	46677045	2	1
TCGA-BR-A44U	22	15294545	36619147	1	0
TCGA-BR-A44U	22	36619224	50796027	2	0
TCGA-BR-A44U	X	251810	2785914	1	1
TCGA-BR-A44U	X	2788903	7457303	1	0
TCGA-BR-A44U	X	7459039	7578533	0	0
TCGA-BR-A44U	X	7579595	111992127	1	0
TCGA-BR-A44U	X	111997607	112208299	2	0
TCGA-BR-A44U	X	112212869	113930962	5	0
TCGA-BR-A44U	X	113935211	114110374	2	0
TCGA-BR-A44U	X	114110598	114425687	1	0
TCGA-BR-A44U	X	114431856	155699837	4	0
TCGA-BR-A44U	X	155733777	156004181	3	1
